Tak jak napisałeś-dysk systemowy zbootuje sie dokładnie z ustawieniami z dnia w którym zrobiłeś kopię/klona i jeśli tam będą przypisania do partycji "D" a tej partycji nie będzie to 1... przwrócisz ustawienia do systemowych lokalizacji C bo D nie będzie, ale te katalogi będa wtedy dziewiczo puste . 2.Zachowasz dane systemowe te które masz teraz na partycji "D: i potem je też przywrócisz....najprościej-to powinneś "Dane z D" równolegle z kopią "C" zachować, bo -Dokumenty i inne- są dla Ciebie ważne i tutaj musisz pamiętać że zawartość kopii tych danych z "D" bedzie też aktualna na dzień w którym to zrobiłeś, taka to jest zabawa w Twoim przypadku jak chcesz zlikwidować obecną partycję/dysk "D".Dla prostoty Kompa robi się to zwyczajowo tak...Dysk z OS, robisz kopię po jakiś istotnych zmianach i jak wszystko poprawnie działa (leniwi ustawiają na automatyczny backup ale ma to wady) zachowujesz po około dwie kopie wstecz, bo i po co wiecej.foldery istotne dla siebie fajnie przekierować na "pewniejsze miejsce-dysk/partycję" i przykładowo.... po "awarii" przywrócenie kopii systemu powoduje ze system wstaje z ustawieniami z dnia utworzenia danej kopii a "dane" na pozostałych partycjach są aktualne na bieżąco-finito.